Поликлиника №69 Отдела здравоохранения Исполкома Перовского райсовета открыта 1 октября 1973 года.

Дата государственной регистрации 09 июня 1997 года.

По приказу Департамента здравоохранения города Москвы от 05.05.2012 № 396 Городская поликлиника № 69 была реорганизована в Государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Городская поликлиника № 69 Департамента здравоохранения города Москвы» и создана в результате слияния трех поликлиник ГП № 69,ГП № 30 и ГП №73 и женской консультации в единый амбулаторный центр.

Территориально ГБУЗ «ГП№69 ДЗМ» с филиалами расположена в двух районах Восточного административного округа города Москвы – Перово и Новогиреево. Эти районы связаны развитой транспортной сетью, что позволяет рационально организовать оказание медицинской помощи населению на площадях всех трех поликлиник без нарушения принципа доступности.

В результате объединения в структуре поликлиники в наличии практически все службы, обеспечивающие медицинское обслуживание населения.

Возглавляет учреждение кандидат медицинских наук, врач высшей категории Шаклычева-Компанец Елена Олеговна.